Pusat Penjaminan Mutu (P2M) Akademi Farmasi Surabaya, bertanggung jawab dalam mengelola seluruh kegiatan penjaminan mutu, dan berfungsi memberikan acuan kepada perguruan tinggi, beserta segenap elemennya, dalam berproses dan melangkah ke depan. Dengan prinsip perbaikan berkelanjutan, sehingga keluaran-keluaran yang dihasilkan oleh perguruan tinggi. Demi terjamin kualitasnya sesuai dengan acuan yang telah digariskan.